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文學院

科系 學位提供
中國文學系
外國語文學系    
歷史學系
圖書資訊學研究所    
臺灣文學與跨國文化研究所    
臺灣與跨文化研究國際博士學位學程(全英語學程)    

農業暨自然資源學院

科系 學位提供
農藝學系
園藝學系
森林學系  
應用經計學系  
植物病理學系
昆蟲學系
動物科學系
土壤環境科學系
水土保持學系    
食品暨應用生物科計學系  
生物產業電工程學系  
生物產業管理研究所    
生物科技學研究所  
國際農碩士學位學程(全英語學程)國合會獎學金學程    
國際農企業學士學位學程(全英語學程)國合會獎學金學程    
生物科技學士學程    
農業經濟與行銷碩士學位學程    

理學院

理學院 學位提供
化學系
應用數學系
物理學系
資訊科學與工程學系
統計學研究所    
奈米科學研究所    

工學院

工學院 學位提供
土木工程學系 
機械工程學系 
環境工程學系  
電機工程學系
化學工程學系 
材料科學與工程學系
精密工程研究所  
生醫工程研究所    
通訊工程研究所    
光電工程研究所    

生命科學院

生命科學院 學位提供
生命科學系 
分子生物學研究所  
生物化學研究所  
生物醫學研究所  
基因體暨生物資訊學研究所    

獸醫學院

獸醫學院 學位提供
獸醫學系

管理學院

管理學院 學位提供
財務金融學系
企業管理學系 
行銷學系  
資訊管理學系  
會計學系  
科技管理研究所  
運動與健康管理研究所    

法政學院

法政學院 學位提供
法律學系    
國際政治研究所  
教師專業發展研究所    

組織工程與再生醫學博士學位學程

醫學生物科技博士學位學程